Oddělení zoologie a botaniky
Dobře vybavené pitevny a taxidermické prostory zoologie nabízejí možnost preparace a konzervace obratlovců, jako je malá myš nebo statný mořský orel. Veškeré dostupné informace jsou rovněž zaznamenány v databázi a lze je kdykoli vyhledat.
Zoologický depozitář je pro uložení takových sbírek optimálně vybaven. Obsahem těchto sbírek jsou kůže, kostry a zbytky potravy predátorů a zvířata konzervovaná v alkoholu. DO sbírky jsou stále znovu předávány nové mrtvé nálezy, které umožňují další výzkum.
Zoologické sbírky
Od roku 1990 se práce v oddělení zoologie soustředí na sběr co nejrozsáhlejších ekofaunálních sérií obratlovců ze západní Horní Lužice.
Botanické sbírky
Botanická sbírka Muzea Západní Lužice čítá v současnosti 2714 inventarizovaných předmětů.